يتكون المجلس العلمي للجامعة من: رئيس الجامعة، ونواب الرئيس، وعمداء الكليات، ورؤساء المجالس العلمية للكليات، ومسؤول المكتبة المركزية للجامعة، وممثلين للأساتذة عن كل كلية منتخبين من بين الأساتذة الذين ينتمون إلى أعلى درجة، وممثلين منتخبين من هيئة الأساتذة، وشخصيتين خارجيتين هما أساتذة في جامعات أخرى. ويمكن للمجلس دعوة أي أشخاص يمكن أن تكون كفاءتهم مفيدة لأعماله.
طبقا للمرسوم التنفيذي رقم 03-279 المؤرخ في 23 أوت 2003 المحدد لمهام الجامعة والقواعد الخاصة بتنظيمها وسيرها، يبدي المجلس العلمي للجامعة آراءه وتوصياته لا سيما فيما يلي: المخططات السنوية والمتعددة السنوات للتكوين والبحث في الجامعة؛ مشاريع إنشاء أو تعديل أو حل الكليات والمعاهد والأقسام، وعند الاقتضاء الملحقات ووحدات البحث ومخابر البحث؛ برامج التبادل والتعاون العلمي الوطني والدولي؛ حصائل التكوين والبحث في الجامعة؛ برامج شراكة الجامعة مع مختلف القطاعات الاجتماعية-الاقتصادية؛ برامج التظاهرات العلمية للجامعة؛ أعمال تثمين نتائج البحث؛ حصائل ومشاريع اقتناء الوثائق العلمية والتقنية. كما يقترح توجيهات سياسات البحث والوثائق العلمية والتقنية للجامعة، ويبدي رأيه في كل المسائل الأخرى ذات الطابع البيداغوجي والعلمي التي يعرضها عليه رئيسه.
